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hola a todos mi problema es el siguiente e puesto un boton html que me permite subir un archivo al servidor pero despues tengo que ejecutar unas rutinas en ASP.Net y ya no con JavaScript conocen alguna forma de mandar a llamar un sub ASP.NET desde JavaScript?

Prueba con la funcion javascript __dopostback() . Esto fuerza a hacer el postback y teines posibilidad de llamar a un sub. Eso si al ejecutar un sub en asp.net se ejecuta en servidor y no en cliente.