Por lo general sólo funciona un servidor mysql por maquina, pero existe la fomra de configurar 2 o mas. Lo he visto pero no recuerdo el link. Despues lo posteo.
Que errores te genera la instalacion de msyql 5.0.9?
Como ya dije antes usas yast para instalar.
Aqui dejo un extracto de una solucion para tener 2 instancias de mysql en una maquina:
Cita: ¡EL demonio no se levanta!, vaya que expresión subliminal. Según pude notar esto se da cuando ya tenemos levantado un servidor MySQL. Claro que esta es una explicación nada técnica. sin embargo podemos encontrar la respuesta haciendo un vi al archivo mysqld_safe, como dice un amigo en *palabras de cristiano, *por defecto MySQL busca la configuración en el siguiente orden:
1. En /etc/my.cnf
2. En el directorio específicado en la opción --sysconfdir de configure, en nuestro caso más reciente (MySQL 4.1) /home/iknaxio2/mysql4.1/my.cnf
3. En el directorio /home, en nuestro caso /home/iknaxio2/my.cnf
Entonces si ya existe un servidor MySQL en funcionamiento es muy probable que tenga fijados los parámetros (puerto o socket) que se encuentran en el primer archivo. La solución que encontré es agregar al mysqld_safe la opción --defaults-extra-file, en cuyo caso el servidor se inicializa con los valores que se encuentran en --defaults-extra-file.
iknaxio2@iknaxio:~/mysql4.1$ ./bin/mysqld_safe --defaults-extra-file=my.cnf&
[1] 14320
Starting mysqld daemon with databases from /home/iknaxio2/mysql4.1/var
Sacado de:
http://www.mysql-hispano.org/page.php?id=40&pag=3 
