Hola, esta consulta mas que de PHP sería de HTML, aún así te explicaré. Debes poner tantos checkbox como posibles opciones existan. El atributo "name" debe ser igual para todos por ejemplo "IDAFILIADO", y en el atributo "value" de cada checkbox pones el valor que tomará cada IDAFILIADO. Ejemplo
Código:
<input type="checkbox" name="IDAFILIADO" value="100">Afiliado 100<br>
<input type="checkbox" name="IDAFILIADO" value="101">Afiliado 101<br>
<input type="checkbox" name="IDAFILIADO" value="102">Afiliado 102<br>
Saludos!!