Les paso todo el código Javascript junto con el div que estoy centrando:
Código:
  
 <head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<title>Untitled Document</title>
<script type="text/javascript" src="http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.3.2/jquery.min.js"></script>
<script type="text/javascript">
    $(document).ready(function(){
 
        // creamos la funcion resize
        $(window).resize(function(){
    
            // aca creamos lo que seria el CSS dandole los atributos y valores necesarios
            // recuerden que deben ponerle el nombre del elemento a centrar (class o id del div)
            $('.cuadro').css({
                position:'absolute',
                left: ($(window).width() - $('.elemento').outerWidth())/2,
                top: ($(window).height() - $('.elemento').outerHeight())/2
            });
 
        });
 
    // ejecutamos la funcion resize
    $(window).resize();
 
    });
</script>
<style>
.cuadro  {
	background:#00F;
	width:50px;
	height:50px;
	margin:0 auto;
}
	
</style>
</head>
<body>
	<div class="cuadro">
    
    </div>
</body>
 
 

