AS3
  Código PHP:
    package {
 
    import flash.display.*;
    import flash.events.*
    public class ejemploCentarElement extends MovieClip {
        public var cuadro:Sprite=new Sprite();
        public function ejemploCentarElement():void {
            stage.align=StageAlign.TOP_LEFT;// IMPORTANTE
 
        
            cuadro.graphics.beginFill(0xCCFF00);
            cuadro.graphics.drawRect(0, 0, 100, 100);
            cuadro.addEventListener(Event.ENTER_FRAME,centarCuadro)
            addChild(cuadro)
 
        }
        public function centarCuadro(event:Event):void {
            cuadro.x=(stage.stageWidth-cuadro.width)/2
            cuadro.y=(stage.stageHeight-cuadro.height)/2
            
        }
    }
} 
    
  el archivo java necesario lo crea el propio flash si no lo tienes aquí  
http://crea-flash.com/AC_RunActiveContent.js 
HTML -- JavaScript  
 Código PHP:
     
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="es" lang="es">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1" />
<title>Tienda Flash</title>
<script language="javascript">var AC_FL_RunContent = 0;</script>
<script src="js/AC_RunActiveContent.js" language="javascript"></script>
</head
<body bgcolor="#FFFFFF" scroll="no" style="margin:0px">
<script language="javascript">
 
AC_FL_RunContent(
            'codebase', 'http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=10,0,0,0',
            'width', '100%',
            'height', '100%',
            'src', 'ejemploCentarElement',
            'quality', 'high',
            'pluginspage', 'http://www.adobe.com/go/getflashplayer_es',
            'align', 'middle',
            'play', 'true',
            'loop', 'true',
            'scale', 'noscale',
            'wmode', 'window',
            'devicefont', 'ejemploCentarElement',
            'id', 'index',
            'bgcolor', '#ffffff',
            'name', 'ejemploCentarElement',
            'menu', 'true',
            'allowFullScreen', 'false',
            'allowScriptAccess','sameDomain',
            'movie', 'ejemploCentarElement',
            'salign', ''
            ); 
</script>
</body>
</html>