es simple lógica gramatical mas que nada XDXD
 
primero todo lenguaje se basa en el ingles por lo que la i representa a index 
para simplificar solo se pone i ,el poner una letra es para reducir el tiempo de escritura  
por ejemplo es lo mismo 
 Código PHP:
    
for( var mivariable_de_indice = 0;  mivariable_de_indice< total;  mivariable_de_indice++) 
    
  que  
 Código PHP:
    
for( var i= 0; i< total; i++) 
    
   la i no esta destinada como variable exclusiva. 
la mayoría de los caso los programadores tenemos como representativo de indice 
a las variables con una sola letra  el caso la i suele ser mas común por lo explicado anteriormente. 
ejemplo 
 Código PHP:
    for( var i= 0; i< 5; i++){
      for( var k= 0; k< 5; k++){
     trace('soy indice i:'+i+' con el valor del indice k:'+k)
      }
}