olas, mira te explico, este es un tema que estoy dando yo aora mismo, gestion de dos o mas sistemas en un mismo Hd. En cuanto a las particiones, te sugiero que dependiendo del uso que le agas a cada sistema dejes mas o menos, yo por ejemplo, casi no uso windows, a no ser para uno o dos juegos, lo demas lo ago con linux. Lo del gestor de arranque, depende de la Distro que elijas, yo por ejemplo tngo Suse 9.1, que te viene con el grub incluido, y casi todas traen uno, ya sea Lilo o el q sea.
En cuanto a lo de instalar uno u otro antes, te aconsejo que instales antes el windows, ya que es mas pesado que Linux y es un poko caprichoso, y puede crearte problemas con el gestor, tu instala windows aciendo antes las particiones, y dejando el hueco pa linux, despues, instalas linux tal y como instalas windows, acetar siguiente siguiente siguiente aceptar (a no se controladores y demas , q supongo que tal y como van de actualizadas las distros lo aran todo ellas)y directamente te pone el gestor Linux, en mi caso Grub, yo te aconsejo que te pilles el Suse, que aora anda por la 9.2, que para empezar esta bien, ni muy simple ni complicada, ad+ de k si tienes algun problema existen miles de foros como este para ayudar. Si tienes tovia alguna duda ,explonla, e intentare solucionarla