Hola 
virtualpyme 
Con HTML tendrías que poner a mano el color en cada fila. Si quieres usar JavaScript, puedes hacer esto:  
 Código PHP:
    <html>
<head>
<script type="text/javascript">
function ini() {
  var par = false;
  tab = document.getElementById('tabla');
  for (i=0; fila = tab.getElementsByTagName('tr')[i]; i++) {
    fila.style.background = (par) ? '#666' : '#090';
    par = !par;
  }
}
</script>
</head>
<body onload="ini()">
<table id="tabla">
<tr><td>Línea 1</td></tr>
<tr><td>Línea 2</td></tr>
<tr><td>Línea 3</td></tr>
<tr><td>Línea 4</td></tr>
</table>
</body>
</html> 
   
  Saludos,