Código PHP:
select t1.idPreguntaxExamen, idExamen, count(*), respuestas from preguntaxexamen as `t1`
left join
( select preguntaxalumnoe.idPreguntaxExamen, count(*) as respuestas from preguntaxalumnoe
where idAlumno='9' and `idAcierto`='1'
group by idAlumno)
as t3
on t1.idPreguntaxExamen=t3.idPreguntaxExamen
group by t1.idExamen