tal vez te refieras al que el usuario, crea una página web en formato html y este pulsa usando IE el archivo y a su vez en esa página tiene creado algún código de javascript. Ahí te sale un mensaje de alerta pero es por cuestión de seguridad. Pero como te indicamos, vienen activados, si no es en todos los navegadores la mayoría, aunque desconozco que navegador no lo tiene activado por defecto.