Cita:
Iniciado por maycolalvarez 
una página jsp embebida (con HTML) es mucho más lenta que un servlet.
Al realizar la primera peticion de una página JSP es compilada y cargada en memoria por el administrador de aplicaciones y se ejecuta igual de rápido que un servlet.
Mi recomendación en cuanto a la protección del código PHP es que utilices algún sistema como PHPCoder (http://phpcoder.sourceforge.net) que funciona con eAccelerator (http://www.eaccelerator.net)
Saludos.