estube viendo la documentacion y probando el morris.js para generar graficos ya que no lo conocia, segun entiendo tu problema pasa que el morris.js no genera el archivo ya que necesitas ejemplo migradico.png para poder agregarlo despues en pdf solo pasandole la ruta donde esta la imagen al fpdf.
trate que el id donde aloja el grafico sea un canvas y despues capturar la imagen y no funciono
