Que tal, si te entendi bien queres hacer el index en flash y luego hacer el resto de las paginas en el dreamweaver. Para esto simplemente en lo botones pones el codigo para que abra los html en la misma pagina que esta abierta el index.
Código:
on(release){
getURL("pagina.html","_self");
}
el "_self" indica que la abra en la misma pagina. Si quisieras que se abra en una nueva pagina pondrias "_new".
Espero que esto te sirva, cualquier otra duda avisame.
Hasta luego.