Otro punto que olvidé que tenés que tener en cuenta:
El directorio donde se encuentra el archivo fpdf con todos los elementos que necesita para generarlo. No olvides que había que bajar un archivo y colocar toda la carpeta en un directorio de tu web, luego, en el include debe dirigirte hacia ese directorio.
Es muy obvio y no creo que sea tu problema, pero me pareció prudente decirlo para estar segura que lo verifiques.