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Hola amigos... me encuentro editando un programa que es openSource y está basado en tecnología j2ee... mi pregunta es la siguiente, como se ejecutan las páginas en esta metodología y de donde se toman lo recursos??..(por ejemplo los css, js, etc..) que están en los java beans. He modificado los .js que se encuentran dentro de la carpeta WEB-INF, sin embargo no me toma los cambios y me toca recompilar tooodo el sitio, crear los JAR, el WAR y volverlo a crear para que me tome los cambios.

alguien me puede dar una pequeña inducción.. gracias.

Hola, todo lo que no sea componentes ni librerías java, va fuera del directorio WEB-INF, pero ubicados dentro de la raíz de la aplicación web. Es decir los archivos js, css, html, jsp, imagenes, van fuera del WEB-INF.

Más info en: http://www.osmosislatina.com/java/wars.htm

Ahora, para hacer un cambio en una aplicación que ya esta empaquetada, pues primero la desampequetas, luego reemplazas el archivo que has modificado, finalmente vuelves a empaquetar y "redeployar" la aplicación (reiniciar la aplicación, no el servidor).

A veces, la aplicación se redeploya automáticamente, esto ya depende del servidor sobre el cual estes trabajando y como este configurado.

Las facilidades de empaquetado (hacer los jar, wars y ears) tambien dependen del IDE con el cual trabajes.