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Si, .. me lo imagino .. Pero, esa es una solución .. de todas formas esos "if()" para llegar a tu SQL "condicional" podrías automatizarlos .. Por ejemplo en $_POST (o $_GET) tienes un array .. como tal puedes recorrerlo con un bucle foreach() y de ahí ir creando tu sentencia SQL (para el caso y para PHP: un string más) concatenando (como cualquier otro tipo de strings).

Si hay soluciones mejores .. supongo que serán vía SQL (en Mysql y su SQL también puedes hacer condiciones "if() .. y demás) .. revisa los manuales de SQL de Mysql o bien consulta en el foro de Base de datos por si existen alternativas mejores del lado del "SQL".

Un saludo,