Bueno .. es eso lo que vas a recibir si aplicas htmlentities() .. De hecho no tiene sentido aplicar htmlentities() en ese punto y luego la función ¿inversa?. Si de tu "HTML area" puede llegar cualquier tag HTML .. si aplicas htmlentities() a todo eso . .no se interpretará todo ese HTML.
Lo que deberías es tener una lista de los tag's HTML que deseas que no se interpreten para descartar los que potencialmente puedan resultar peligrosos. En ese caso usarías:
strip_tags()
www.php.net/strip_tags
Un saludo,