Sorry, el .htaccess es asi:
RewriteEngine on
RewriteRule ^modulos/.* index.php
Tal como te decia, eso significa que si alguien tipea en la barra de direcciones:
http://www.tusitio.com/modulos http://www.tusitio.com/modulos/algunarchivo.php
el servidor va a asumir que le esta pidiendo cargar el archivo index.php (que es tu homepage)