hummm... yo te aconsejaria que dentro de tu index lanzaras la nueva ventana la cual tubiera realmente el contenido de tu web y asi evitas que aparescan las herramientas o si lo prefieres coloca un link en el index y usa el siguiente JS
<a href="/tu_pagina.htm" target="_blank" onClick="window.open(this.href, this.target,'width=800,height=600');return false;">LINK</a>
Suerte!
360.