Habría que ver en que médio quiere el informe .. pero normalemnte cuando hablamos de "informe" solemos aplicarlo a que es "impreso" .. por ende el mejor formato sería el PDF.. Otra cosa es hacer "informes" en "pantalla" .. ahí usamos HTML ..
El caso es que deberías hacerte tus "métodos" (funciones, etc) para obtener tus datos que requiera tu informe y luego componer con esos datos el informe según el médio: ya sea un PDF o algo para ver en "HTML" ..
En sitios como
www.phpclasses.org seguro que encuentras alguna ayuda para crear esas "tablas" en HTML que darán de cierta forma el formato a tu informe .. pero si este es complicado .. (con sub-reportes .. etc) ahí no sé como se lo harán.
Lo importante es que te hagas tus funciones para recolectar esos datos que va a tener tu informe (sea para el médio que sea) a base de tus consultas SQL a tu BD o al médio que los contenga y de ahí generar algún objeto u array que "pasarlo" al "método" que "genere" el informe .. así podrás tener funciones/métodos para generar un informe en "PDF" por ejemplo .. otro para HTML (con paginado tal vez) .. otro en XML (o derivado como RSS y compartir datos entre aplicaciones .. por ejemplo) .. etc.
Lamentablemente . .hasta para crear un PDF se hace más bien "a mano" con mucho código PHP y nada "visual" (como podría ser en otros lenguajes usar cosas como "Cristal Reports" o similar).
Un saludo,