mm que se compren el paquete completo de Adobe PDF o cualquier otro editor de PDF xDD. Así podrán editar los PDF's que tu generes como ya lo haces.
Lo otro es generar documentos como los que crea OpenOffice .. (en versiones windows y linux)
http://phpdocwriter.sourceforge.net/...on.php?lang=es
Y por último, definitivamente abandonar PHP, desarrollar en .NET o plataformas "M$", ahí podrás usar "COM" fácilmente. Eso te forzará a usar servidores Windows y todo bajo windows.
En PHP puedes usar "COM" (usando servidores bajo Windows y con Office instalado en el)
www.php.net/com ..
Yo sé que tu "cliente" te pide lo que te pida .. pero tu como "profesional" ha de hacer entender que no todo es posible como lo desean pero si que hay alternativas como las que te propongo .. o las que ya conoces tu mismo .. es decir, si tu aplicación genera el "PDF" en función de los parámetros que tu aplicación define .. llega a un consenso de "que partes son las que tanto desean modificar" para que crees nuevos campos en tus formularios y demás ..Todo esto teniendo en cuenta de que tu -aplicación- no es una "maquina de escribir electronica" .. (por qué a veces parece que así lo ven ..) es algo más que eso, pese que genere un documento como antes lo hacían con "word a mano".
Un saludo,