Hola:
La verdad es que yo siempre utilizaria rutas relativas y no absolutas para tus includes, si tienes problemas con los includes es porque debes tener mal organizadas tus carpetas y archivos.... debes tener en cuenta que siempre que se trabaja con includes es preferible tener esos archivos (en tu caso la cabecera) en el directorio raiz y desde cualquier directorio que llames a la cabecera podras hacerlo con ruta relativa ademas si tienes una imagen u otro codigo en tu cabecera puedes guardarla en directorios y ser llamados desde tu cabecera a pesar de que llames a la cabecera desde diferentes rutas....
Organiza mejor la estructura de tu WEB (teniendo encuenta los INCLUDES) y tendras mejores resultados
Saludos