Hola =Clo=, bienvenido a los foros
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Fíjate en las FAQs que hay información de los popups (FAQ100)
El tercer parámetro del método open, son las opciones de las nuevas ventanas, entre ellas width y height... para el caso de 800x600 sería:
window.open("popup.html", "", "width=800,height=600");
Saludos
