Puedes hacer asi:
Código PHP:
<?php
$fecha = "año/mes/dia";
$temp = explode("/",$fecha);
$fecha = $temp[1]."/".$temp[2]."/".$temp[0];
echo $fecha;
?>
Alli use la funcion explode() que divide una cadena por medio de un caracter defino en el caso tuyo el signo "/", creandome 3 elemtos en un array, y lo ordeno a mi gusto.
Para leer sobre explode()
http://www.php.net/explode