El MSDE como es version gratuita no tiene GUI, lo tienes que hacer desde tu consola msdos ((algo así como mysql) para crear las tablas, probar queries, etc.. mediante el OSQL. , aunque tambien hay en la red varios GUI´s para MSDE.
Pero si tienes la version de sql server puedes crear la instancia del server que tienes con msde y trabajar desde tu entrerprise manager de forma normal.
Salu2