Un include obliga a que el cliente soporte tu misma tecnologia, es decir, si tienes un ASP, el cliente debe tener ASP para poder incluir un include que tu le mandas y ejecutar localmente el codigo de ese include, tambien esta el caso donde..
Cliente usa solo HTML, sin PHP, ASP, nada, entonces si tiene que hacer un include no puede hacerlo, con este metodo, esta jalando todo desde el servidor, y se ejecuta en nuestro servidor, no se si me explico.
El caso es que puedes tener:
pagina.htm ---> jalar desde Script
http://midominio/funcion.asp
pagina.php ---> jalar desde Script
http://midominio/funcion.asp
pagina.asp ---> jalar desde Script
http://midominio/funcion.asp
Y todas funcionan, porque todo se ejecuta en el servidor, no en el cliente, ademas con esto hay muchas facilidades como que el cliente no tiene que estar programando nada en su ASP, solamente cuestion de cambiar un parametro en su HTML.
Bueno, esa seria la diferencia.
Por otra parte... me parece, no estoy seguro, que con ASP por ejemplo, no puedes tener includes remotos, como
<!-- include virtual "http://www.midominio.com/funcion.asp"-->
Pero no estoy totalmente seguro.
Saludos!!