De hecho no tendría que haber ningún problema con eso de las llamadas a las funciones. simplemente crea una función en la línea de tiempo principalÑ
Código:
function alguna():Void{ trace("Se ejecutó la función");}
y en un MovieClip que esté incrustado en la línea de tiempo principal la mandas llamar con la siguiente instrucción:
Código:
this._parent.alguna();
//y si no te funciona, entonces hazle desde ese MovieClip un trace dirigido a esa función a ver si existe o si la ve.
trace(this._parent.alguna); //Te debe de dar como resultado [Type Function]