Hola 
paulodic 
Un par de ideas: 
Para iniciar un temporizador utiliza 
pepe = setInterval('contar()',1000) (con esto se ejecutará la función contar() 1 vez por segundo) y para pararlo 
clearInterval(pepe) 
Además necesitarás una variable global para llevar la cuenta de los segundos. 
Espero haberte orientado un poco. Saludos, 
