Son varias las ideas que se me ocuren para solucionar este "problemilla"
te comento una:
podrias crear una tabla en MySQL con los siguientes índices...
id_facu,n_orden
id_facu: Campo que tendrá el id de cada facultad, en tu ejemplo 45
n_orden: allí se guardaria el numero del carnet, para el primer registro, el 1..
Ahora:
cada vez que guardes a un alumno nuevo, deberias consultar esta tablita filtrando los datos de la facultad numero 45, seleccionar ese registro y sumarle uno al n_orden
me explico??
Te dejo un Saludo y suerte...
