como asigno a variable php valor de java script

[illman]

Si te he entendido bien, tienes un avariable en JavaScript y quieres que ste disponible en PHP?
El PHP es un lenguaje de lado servidor, y el JavaSript de lado cliente, por tanto conso el Java tiene la variable, el PHP ya ha acabado de ejecutarse, y no podrás recoger ese valor, una solución por el ejemplo que pones sería mardarla por url.. dependiendo de donde salga ese valor.

window.open('informes/resultado_informes.php?cdciclo=VALOR','popup','wid th=750,height= 350');

así tendrás el valor como $_GET['cdciclo']:

Espero haberte ayudado, aunque mucho me temo que no será así.