Puedes usar la función sleep()
y si no quieres q se quede el script como si estubiera cargando la pagina hasta q termine..puedes utilizar la función...
register_shutdown_function() para dejar el script en modo background.
en la web de php.net hay un ejemplo de utilización de ambas cosas...
http://es2.php.net/register_shutdown_function
Salu2.