Tiene una explicación, bajo MS-DOS se requieren de ciertos drivers que junto al comando MSCDEX hacen que sean ya reconocibles tus unidades de CD/DVD, de todos modos si dispones del disco de inicio del Windows 98 no tendrás mayor problema ya que este te los carga, en caso que no lo tengas aquí puedes conseguirlo
http://www.bootdisk.com/
Salu2.