Includes con clases o sin clases?

[mariano_donati]

Hola, estoy intentando de estructurar de mejor manera mi código,y me veo ante este dilema: definitivamente lo voy a hacer con includes que contengan funciones y procedimientos, pero será mejor que estas funciones y procedimientos formen parte de una clase y luego instanciar? o es mejor dejarlos libres y llamarlos desde el código cuando haga falta?.
Muchas gracias por sus respuestas de ante mano.
Suerte!