si te hace falta solo 1 registro ponele LIMIT 1, antes de cerrar el parentesis de la query anidada, asi solo te toma la primer coincidencia q encuentre
yo no uso los GET y los POST en las querys ya q suelen tener problemas con los ' ' asi q le asigno sus valores a alguna variable
Código PHP:
$var=$_GET['provider_id'];
SELECT call_id
FROM countries
WHERE name IN (SELECT country FROM provider WHERE provider_id='$var' LIMIT 1)
yo usaria algo asi
espero te sirva saludos