Hola hunabku, recuerda que vb.net es un lenguaje Net.. y el que trabajes con windows forms, web forms, web services, mobile, etc... es otra cosa.. me imagino que estas hablando de aplicaciones web (asp.net) y por lo tanto necesitas el IIS para correr tus aplicaciones con el framework instalado obviamente en el server.
Checalo y cualquier otra duda que tengas nos avisas.
Salu2