Por mi parte te preguntaba (punisher_mx) por qué defines cookies desde javascript y no lo haces desde PHP .. (no sobre la necesidad de tus cookies es lo que mencionas es perfectamente válido).
Cita: archivo js tome el valor de una variable php
ejemplo:
nose.
php Código PHP:
<?
$variable_php="php";
?>
<script languaje="javascript">
var variable_javascript=<? echo $variable_php ?>
</script>
Es "PHP" quien genera tu javascript .. en consecuencia así le "pasas" variables a javascript desde PHP .. Recuerda que PHP se ejecuta en el "servidor" y javascript en el cliente.
Un saludo,