Menu en javascript y barra de scroll

[Noeia]

Estoy utilizando un menu desplegable lateral en javascript y la barra de scroll de la página sigue desplazandose y me deja la página al final con una parte en blanco.

Probé con suprimir al final como haría con cualquier página pero no funciona, sólo cuando quito la parte del menú que va en el body la página queda bien, pero obviamente el menu no funciona.
También me pasa que a veces carga bien y la barra de scroll no se va para arriba, como puedo arreglar eso.