Lo que haría normalmente es conectar el nuevo disco como secundario, irme a la shell y darle partición, pero cuidado, debes cambiar posicisión de disco antes de ejecutar el fdisk, para que no le des partición al disco principal.
Lo que preferiría hacer es consegirme el Disk Manager (o administrador del disco duro) que corresponde al modelo que entrega el fabricante al cual optaste, y con ese Disk Manager darle partición y formato, ademas de que puede traer información adicional para ciertos casos.
Saludos...
