Puedes colocar valor1 y valor2 concatenados y separados por algún símbolo que prefieras, como una coma.
Luego los recibes y formas un array de ambos valores con la función explode.
Algo así:
Código PHP:
if(isset($_COOKIE['micookies'])) $cookie=explode(",",$_COOKIE['micookies']);
Donde $cookie[0] será tu primer valor, y $cookie[1] tu 2º valor.
Saludos.