Hola,
Un servidor FTP es una máquina que da servicio FTP... claro...
... esto no ha quedao demasiado revelador...
El servicio FTP es otro más como puede serlo el HTTP (páginas web), el SMTP, POP3, IMAP (correo) el NTP (hora), el NNTP (noticias), etc..
El FTP sólo sirve para transferir ficheros, es como si usaras el explorador de archivos pero en otro ordenador.
... si siques sin verlo claro, avisa ...
Saludos.