en principio no tiene q ver una cosa con otra, y da igual q sistema operativo tengas, si lo haces desde windows asegurate de tener la aplicacion que corresponde para actualizarla desde el y si lo haces a traves de una consola de comandos igual, el programa para actualizarla desde ahi. en linux idem de idem
lo q si tienes q tener muy claro es el archivo de actualizacion, saber con seguridad q ese archivo es el de tu placa, y rezar para q en esos pocos segundos q dura la actualizacion no se vaya la luz
