No sé si conoces que en forosdelweb.com disponemos de un foro exclusivo para temas de Base de datos . .Usalo!.
De todas formas .. no estaría de más leer la documentación oficial de Mysql en primera instancia y luego si no entiendes algo .. pregunta dudas concretas:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...e-engines.html
Y también:
http://www.mysql-hispano.org/page.php?id=26&pag=1
(explica un poco las diferencias entre MyISAM e InnoDB)
Es importante que concretes que versión de Mysql usas .. no todo tipo de tabla puedes usar en todas las versiones.
Un saludo,