Manual no he visto de "uso" entre otras cosas por qué phpMyadmin es un "GUI" para Mysql .. es decir un "Graphical User interface" . .así que la mayoría de terminos que emplea y funcionalidades se refieren al SQL o funcionamiento de Mysql en concreto.
Por ende .. cuanto más conozcas de SQL veras que usar phpMyadmin no tiene tanto.
De todas formas .. en la sección de documentación de phpMyadmin aparecen algunos "Tutoriales" .. pero OJO .. por qué si no conoces algo de los conecptos que ahí traten (y que no deben tratar en un "tutorial de uso de cierto gui" .. ) te quedarás igual .. Ataca el problema primero entendiendo como funciona Mysql y su SQL.
http://www.phpmyadmin.net/home_page/docs.php
Un saludo,