Cita: Como bien dices, este método no es aconsejable si vaz a manejar muchas imágenes, en este caso podrías guardarlas físicamente pero fuera de la carpeta de la raíz de tu sitio, debajo de la carpeta "www" ó "public_html" como comúnmente se le nombra.
Sería "arriba" (un pequelo desliz) de esas carpetas que normalmente es donde apunta el "document root" y todo lo que se publique ahí quedará disponible para llamarlo por el URL:
http://www.sitio.tal/nose.jpg
Un saludo,