Se me ocurren muchas razones por las que tener windows 98 y 2000, la primera de ellas por ejemplo para los juegos el sistema por excelencia de los "jugones" es el 98 ya que es el que chupa menos recursos y rinde mejor para los juegos y Windows 2000 se puede usar para muchísimas cosas interesantes, como el sistema operativo más estable de Guindos hasta la fecha incluso más que el XP, el mejor sistema para servidor web, ficheros, directorio activo, gestión de redes de Guindos et..... hay muchas más razones.
Algo sobre lo del NTFS puedes leerlo en el apartado 2 de la siguiente página:
http://linux-ntfs.sourceforge.net/info/ntfs-es.html
Saludos