en realidad tu pregunta se responde con javascript no con html.
Código:
<a href="#" onclick="window.open('algo.htm','','toolbar=0,location=0,status=0,menubar=no,scrollbars=1,resizable=0,width=250,height=180')">Link</a>
las opciones que estan en negrita son las que deberias cambiar para darle una tamaño especifico a tu ventana