Bueno, nuestro moderador podrá decir más que yo en ese sentido, pero creo que aquí la clave es que trabajas sobre un linux, supongo sobre un SUN ASP. La verdad desconozco si dicho SW soporta también JSSS (JavaScript Server Side) dado que solo se que implementa vbscript. Si ves los códigos del fpdf estan hechos en jsss y no en vbs.
Esa es la muy probable respuesta a por que no funciona, y conociendo a linux lo poco que lo conozco, si acaso lo soportara, seguramente hay que decirle explicitamente que ejecute dicho lenguaje en algún archivo de configuración, sería cosa de investigar en la documentación del SUN.
Ahora, buscando por ahí encontre posibles "soluciones" a ese error:
http://swforum.sun.com/jive/thread.j...8813&tstart=30 (respuestas 3 y 5)
http://www.codehound.com/groups/thread.asp?t=1,187,1,
[email protected]. co.uk_187
Si ves que no funciona o no viene Al_Zuwaga pro aquí a iluminarnos con su sapiencía, pues abre un post nuevo con un tema como: "fpdf no funciona sobre linux" o algo así para que llame su atención. Por mi parte trataré de buscar algo más aunque como no puedo reproducir el error lo veo dificil.
Saludos