Con porcentajes las medidas se ajustan, yo así lo practiqué en
www.512megas.com, no tendrás problemas al estar con resoluciones distintas o diferentes tamaños de ventanas, siempre se ajustará perfectamente (cuando lo implementas bien).
En realidad está siempre el eterno dilema de tus visitantes: ¿quieren barras de desplazamiento (medidas fijas) o quieren que la página se ajuste a la ventana (medidas relativas)?