Lo mas común es por ejemplo que en tu index.., coloques dentro del head el siguiente meta tag.:
Cita: ...
<head>
<META HTTP-EQUIV="Refresh" CONTENT="1; URL=www.misitio.com/nuevaversion">
</head>
Y por ejemplo.. presentes una página donde digas que ya se cambio la liga para que los usuarios estén enterados..
Te mando un ejemplo:
http://rs.internic.net/
A los 8 seg te redirecciona a otro site..
Salu2