Eso se arregla fácilmente con el adecuado archivo
.htaccess
Lo que le estarías diciendo al robot de Google o cualquier buscador es algo así.
"
Te agradezco que hayas visitado mi sitio web http://misitio..., pero mi dirección real es http://www.misitio..., por lo que te pido me indexes sólo de esa forma, así no reparto mi pageRank y tú no te molestas ni me penalizas por pensar que yo tengo contenido duplicado en mi sitio web."
Hay mucha documentación sobre el .htaccess en
forosdelweb.com, además de que son sólo 3 o 5 líneas. Vale la pena.